國家外匯管理局為副部級國家局，內設綜合司（政策法規司）、國際收支司、經常項目管理司、資本項目管理司、管理檢查司、儲備管理司、人事司（內審司）、科技司等8個職能司（室）和機關黨委，設置中央外匯業務中心、外匯業務數據監測中心、機關服務中心、外匯研究中心等4個事業單位。

綜合司（政策法規司）。負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作以及安全保密、應急管理、新聞發布等工作；負責機關財務、資產管理、外事管理工作；研究有關外匯管理的重大問題並提出政策建議；參與起草有關法律法規、部門規章草案；承擔機關規範性檔案合法性審核和重要綜合性文稿的起草工作；承辦相關行政應訴、行政複議和聽證工作。

國際收支司。承擔國際收支、外匯收支、結售匯統計制度的設計、實施和報表編製工作；承擔跨境資金流動的監測、分析和預警工作；承擔銀行外匯收支及銀行自身結售匯業務監督管理工作；承擔全國外匯市場的監督管理工作；監測人民幣匯價，向中國人民銀行提供製定人民幣匯率政策的建議和依據。

經常項目管理司。承擔經常項目外匯收支、匯兌真實性審核及境內外外匯賬戶的監督管理工作；承擔保險類金融機構相關外匯業務市場准入及外匯收支和匯兌管理；擬訂攜帶、申報外幣現鈔等出入境限額的管理規定。

資本項目管理司。承擔資本項目交易、外匯收支和匯兌、資金使用和境內外外匯賬戶的監督管理工作；依法負責直接投資登記、匯兌管理及相關統計監測；承擔短期外債、或有負債、對外債權等的相關管理工作；承擔全口徑外債的登記管理與統計監測；承擔除保險類機構以外的非銀行金融機構相關外匯業務市場准入及外匯收支和匯兌管理；依法對跨境有價證券投資或衍生產品交易所涉外匯收支進行登記和匯兌管理。

管理檢查司。依法組織實施外匯檢查工作，對違反外匯管理的行為進行調查和處罰；參與打擊地下錢莊，協助公安司法機關調查非法買賣外匯、逃匯及騙購外匯等涉嫌外匯違法案件；承擔對機構和個人外匯收支及外匯經營活動的檢查工作。

儲備管理司。研究提出國家外匯儲備和黃金儲備經營管理戰略、原則及政策建議，組織總體經營方案的擬訂和實施；監督檢查委託儲備資產的經營狀況；承擔與國際機構之間相關的協調與合作，參與有關國際金融活動，承擔與港澳台交流合作的有關工作；研究擬訂其他外匯資產受託經營原則。

人事司（內審司）。按照管理許可權負責國家外匯管理局機關及直屬事業單位的人事工作；承擔國家外匯管理局退休人員管理工作；根據授權，承擔國家外匯管理局的內審工作。

科技司。擬訂外匯管理科技發展規劃，承擔全國外匯管理系統科技發展工作；研究制定外匯管理資訊化的標準、規範並組織實施，依法與相關管理部門實施監管資訊共用；負責國家外匯管理局資訊安全工作。

機關黨委。在國家外匯管理局黨組的領導下，按照中國人民銀行機關黨委工作要求，負責國家外匯管理局機關、直屬事業單位的黨建、紀律檢查、巡視、工會、共青團、婦女、統戰、定點幫扶等工作。

中央外匯業務中心。根據《中華人民共和國中國人民銀行法》和《中華人民共和國外匯管理條例》，按照國家外匯儲備經營戰略、原則，負責國家外匯儲備和黃金儲備的經營管理；服務國家實體經濟發展，拓展外匯儲備多元化運用；經批准受託經營管理其他資產等。

外匯業務數據監測中心。負責網路和應用系統建設，組織外匯管理資訊系統及技術工程的建設、應用推廣、運維與應急保障；負責立項和電子化建設資金使用；負責外匯管理電子政務建設；負責外匯業務數據的採集、管理及監測；負責指導分支機構網路和資訊系統建設；負責備份中心（同城、異地）的技術管理與運維；承擔外匯管理網路安全保障工作；負責具體實施全國外匯管理系統科技發展規劃及資訊化標準、規範；負責執行與相關部門的監管資訊共用。

機關服務中心。制定局機關事務管理工作規劃和制度，負責局機關事務行政管理工作，為局機關提供後勤保障服務。

外匯研究中心。負責對外匯管理實踐及體制改革涉及的經濟金融問題，開展系統深入的理論和政策研究，為制定外匯管理政策、推動外匯管理改革、防控外匯市場風險提供政策建議；開展外匯管理政策解讀、政策宣傳及對外學術交流合作的相關工作；編輯出版《國家外匯管理局年報》《中國外匯》雜誌等。