国家外汇管理局新疆维吾尔自治区分局位于新疆维吾尔自治区首府——乌鲁木齐市。国家外汇管理局新疆维吾尔自治区分局下设三个处室，分别是国际收支处、外汇管理处和外汇检查处。下设14个分局，分别是伊犁州、阿勒泰地区、塔城地区、博州、克拉玛依市、石河子市、昌吉州、吐鲁番市、哈密市、巴州、阿克苏地区、克州、喀什地区、和田地区分局。